华佗对脏腑辨证的关系较前人有所发挥，发挥了《素问》、《灵枢》的色脉诊以及辨脏腑的虚实寒热的病症。其中，以《中藏经·论五脏六腑虚实寒热生死逆顺之法》最有代表性。华佗在《素问》、《灵枢》的基础上，把脏腑辨证的理论系统化，并大大提高了一步，具体反映在《中藏经》和《内照图》中。首先明确：凡欲知五脏之病，先须识脉，知脉即知病源，知源即不错疗。例如，辨心脏的脉象、症状，其作用号称总指挥，神之所舍又生血，旺于夏，属手少阴经，与小肠互为表里，并以夏脉钩、来盛去衰故日钩。反此者病，来盛去盛，病在外；来衰去盛，病在内，描写心脏正常与不正常的关系，其次分析夏心旺，左寸脉洪浮大而散日平，反此则病而有沉滑，弦而长，缓而大，与肾、肝、脾的关系及心脏自病的症状，心病则胸中痛，四肢满胀，肩背臂膊皆痛；虚则多悸，无眠，胸腹及腰背引痛，喜悲时眩外。心虚嗜惊，心虚寸濡弱，心虚成恐惧。心热狂走，心热寸洪数，心热风狂走。心风嗜忘，心风寸浮数，心风成癫痫。据此，癫痫与心脏的关系紧相连，善于辨别当脏之风、气、冷、热、虚，外加心积，积与气连，沉而空空然，上下往来无常处，气以不去则忧烦，心中痛，嬉笑不休。 
除本脏自病外，必明五脏相人，这点对癫痫的辨证太重要了。例如，肝风人心为癫痫；肾风人心为癫痫。辨证时究竟属何脏所致，应彻底弄明白才不至于误会病机。除心脏自身外，各脏人心；心入肺脾肾；肾人心肺脾；肝人心脾；脾入心肺，肺入心肝，此为五脏之相入。然后必须熟记相人后之症状，肝风入心，成瘰疬，项筋急，头痛、舌缩、壮热。有位女患者，癫痫发作时全身抽搐、小便失禁。最大特征是有预兆，开始时说不出话，舌头往里缩，旋即昏不知人事，这显然是肝风入心了，而不是肾风入心或本脏自病。按此治疗，效果极佳。虽明五脏相入，仍然不够，还须明脏腑相入，心病入小肠。除按风、气、冷、热、虚分析外，《中藏经》日：“小肠主于舌之官也，和则能言而机关利健、善别其味也，虚则左寸脉浮而微弱不禁按，病惊狂无所守，下空空然不能语者。”这与舌咽神经、舌下神经等有关。把脏腑辨证与定位诊断联系起来，其妙无穷。结核性脑膜炎、散发性脑炎后遗症等皆与舌下神经有关联，善医者把各方面的知识结合起来，对癫痫的治疗极有益处。 
同理，依据华佗《中藏经》可以分析肝脏的脉证。肝属厥阴，主春气与少阳为表里，以嫩而软，虚而宽，表现肝主柔和及舒泄之征。再分析弦脉乃肝所特有及弦虚、弦实、弦长之不同，而有不同病变；又根据《灵枢》大小缓急滑涩六脉提出肝的病脉及主症。最后以左关上迟而涩；阴实者，沉而弱为肝中寒、中热、虚冷三个大的症候。以脉之微涩为疚挛的判断。《素问》病机十九条有“诸风掉眩皆属于肝”之理。这成为历代各家治疗癫痫的基本理论和可靠根据。所谓肝风内动也渊源于此。中医所指的“肝”是广义的，包括神经系在内。癫痫的辨证，很注意对肝胆的辨证，胆又与肝互为表里，有很多的癫痫患者睡眠不好，不但要考虑心肾方面的病证，更应该考虑胆方面的病证。胆虚冷无眠，其关上脉阳微者，胆虚也。 
以此类推，可以辨别其他脏腑，此处就不再分析了。 
脏腑辨证最好借用者就是《中藏经》。《医学启源》五脏六腑，除心包络十一经脉证法，亦多采自《中藏经》。东垣的老师张元素即是如此。把它借用于癫痫的辨证，效果很好，这是实践的体会，也是肺腑之言。除此之外，钱仲阳的《小儿药证直诀》这本儿科专著是有关脏腑辨证的好书，很值得一读。特别是其对癫痫的辨证论治有很多可取之处，有论、有法、有方、有案。钱氏立论专以病形为主，以症之现于外者定其为风、为火，别其属于何脏，尔后议用何药，朴实精细，毫无影响之词，所以，为儿科之祖也。 
钱仲阳虽有急慢惊之文，而治法则不从惊治，急惊专主风痰，利惊凡除其痰热且禁用巴豆热药。又申言，热极自能生风，不必闻声惊恐，自能发搐。显然这种诊断涉及了抽风的本质。现在仍有人认为癫痫是惊吓引起的，把触发条件认为本质是不妥当的。 
钱钟阳的《小儿药证直诀》下卷有救逆之方，很有参考价值。急惊多由风痰食积引起，慢惊亦由脾胃损伤，过用大温热之药，以耗津液引起，以致热证烽起，钱氏豆卷散，救败之方；又有虚风方及虚风又方二方，救过服凉药脾虚生风因成慢惊之方。癫痫有的是因治疗不当，逐渐形成神经器质性损伤，懂得救误之法是很有价值的。 
钱仲阳以五脏所主，将五脏病逐脏分析症状及辨别虚实热风等，有条不紊，很值得研究癫痫者一读。 
肝主风，实则目直、大叫、阿欠、项急；虚则咬牙，多欠。 肝有热，手寻衣领及乱捻物。目直不搐，得心热则搐。 
肝有风，目连眨不搐，得心热则搐。急惊热甚风生，风属肝。 心主惊，实则叫哭，发热饮水而摇。虚则卧而悸动不安。 
心有热，视其睡，Fl中气温或合面睡及上蹿咬牙，皆心热也。 脾主困，实则困睡，身热饮水；虚则吐泻生风。
此三脏之症状，在临床极易见到，中毒型菌痢引起的抽搐，急性期的抽搐也好，后遗症引起的抽搐也好，皆按脾胃治之。笔者在四川开江讲学时，有一患者患癫痫数年，有一特殊症状，即手寻衣领及乱捻物，按肝有热治之，很快控制了癫痫的发作，钱仲阳之语不虚。钱氏之方，重在善用。 
又如某患者1971年始发癫痫，致病原因不明，有肾炎史，也有过高热史，但都没有导致癫痫发作。头颅CT扫描正常，脑电图检查中度异常。 
主要症状：睡不好、梦多、疲劳、乏力、面自，常感觉右侧头中动，有时头右侧亦痛。癫痫每月发作二三次，患后有汗，严重时小便失禁，昏睡半日即过。 
脉象：左手三部皆沉，右手尺大于寸关且浮。 舌苔：薄白略干，舌尖淡红。 
治则：坚持养阴熄风，恒用钱氏六味地黄丸作汤加减使用。由于左手三部脉沉力不及右，加之舌尖淡红，交替使用了一段时间的生脉饮加味治疗后，癫痫1年没有发作，梦少而能熟睡了，能坚持工作。 
 钱仲阳认为，心主惊，虚则卧而悸动不安。考之动物，马无胆，马善惊，从胆治。患癫痫目张不得明、人不知何故?目系内连肝胆，因恐而发者则气结胆，冲不下，用温胆汤加味治疗，目则瞑矣。这里避开了钱氏只从心治，治惊多主痰热之法，笔者结合实践创造了新方法。但又不能不再三重申，因惊致痫者甚少，因病致痫者甚多。在临床中，不少患者叙述因惊恐得癫痫，医者必须仔细辨别，以免误人。因惊得病，必大声惊吓或异形猝见，患者必惊惧异常，即所谓“大惊卒恐气血分张”，对此种证候乃可以惊治之。精神高度紧张，气血冲于上，使神经受损。笔者在所医治的众多患者中只见3例，现举其一。某医院护士，16岁时某夜晚推死尸入太平间，途中推车翻倒，死者之子大声疾呼：“我父活了。”刚巧该护士的脸_正碰到死者脸上，卒恐异常，当晚即发癫痫，但以往从无此病史，故可按惊治之。但切不可把个别例子当作普遍规律，这是心灵深处的话，言之再三。 
把癫痫病症之一的易惊与因惊发病、因惊致病区别开。要辩别是外物惊，还是内动惊，其治有东垣安神丸、钱氏安神丸之别，辨证必须细致，治疗才准确有效。 
肺主喘，实则闷乱喘促，好饮水，亦有不饮水者。虚则硬气长出气、实则泻白散，葶苈丸主之。虚则阿胶散、生脉散合甘桔汤主之。 
特别要注意兼证。兼见心证，发热、饮水、喘咳、闷乱，此心火胜也，宜凉膈散加知母石膏主之。兼见肝证，钱仲阳所谓三泻肝而肝病不退，三补肺而肺证尤虚之语，这点在高热惊厥中再论。 
肾主虚无实，地黄丸主之。在上面的病例中已经讨论过了。要懂得六味地黄丸之用，必须参阅薛立斋、张景岳、赵养葵等的著作，才能深入领会，否则无的放矢，是不会收到很好的效果的。 
钱仲阳杂病症四十五条，皆儿科之秘诀，可与《素问》病机十九条同样看待。仅举其一，吐泻昏睡露睛者胃虚热；吐泻昏睡不露晴者胃实热。由露晴与不露睛判断虚实，简单明了，一望便知，不致犯虚虚实实之弊。